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俄罗斯专享会284:无需培养的全亚型结核耐药基因靶向NGS方案

发布时间:2025-02-24   信息来源:祁若彪

结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是一种全球的重要致病菌,它引发的结核病被认为是一种高致死性疾病。标准株H37Rv于1998年完成基因组测序,其基因组大小约为44Mb,包含超过3900个蛋白编码基因。当前,结核分枝杆菌被分为七个主要谱系,已知的耐药基因包括embB、rpoB和gyrA等。

俄罗斯专享会284:无需培养的全亚型结核耐药基因靶向NGS方案

2023年10月17日,世界卫生组织(WHO)在其官方网站发布了《应用新一代测序检测技术开展耐药结核病监测的实施性手册》。WHO指出,下一代测序(NGS)能够提供全面的耐药谱系检测,显著降低对表型药物敏感性检测的需求,对于那些表型药敏检测不可靠的药物尤为重要。NGS技术有望为制定结核病治疗方案提供更全面的耐药谱检测,从而提高化疗方案的精准性。

由于结核杆菌的基因组较大,目前的靶向NGS方法(tNGS)大多无法覆盖所有亚型及耐药基因。尽管全基因组测序(WGS)能够覆盖整个基因组,但其需依赖于培养物以确保检测的可靠性,为此,QIAGEN推出的俄罗斯专享会284 QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel,能够在无需培养的情况下直接实现结核全基因组的靶向建库,并且覆盖七种主要谱系亚型及所有已知耐药基因。

QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel基于杂交捕获技术,支持痰液、脑脊液、粪便等样本的TB全基因组测序,起始DNA量仅需10ng,无需预先培养。这一高特异性和灵敏度的捕获系统,即使在低拷贝样本的情况下,也能实现基因组的高覆盖率,特别是在难以覆盖的PE/PPE基因区域,也能实现均匀的高深度覆盖,从而明确进行TB分型。

完成TB的全基因组数据获取后,研究人员可以使用CLC Genomics Workbench的结核分枝杆菌分析工具进行一键式质量控制、序列比对、谱系鉴定及耐药变异分析。此外,系统还支持变异注释、比较分析、评估变异对蛋白质结构的影响,以及cgMLST分型、最小生成树构建及SNP tree分析等。

除QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel外,QIAGEN还推出了同样覆盖丙肝病毒所有亚型的QIAseq x HYB Hep C Panel,且能够无缝连接至CLC Genomics Workbench进行生物信息学分析,确保用户能够一键获取分析结果。未来,QIAseq x HYB也将推出针对特定客户需求的定制化靶向Panel,敬请期待!如需了解更多信息,请扫描下方二维码与我们联系。