近期,华大智造对其DNBSEQ平台的甲基化建库与测序进行了全面升级,推出了新一代建库产品——MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasy Whole Genome Methylation Sequencing Library Prep Kit V30,以下简称WGMSV30)。WGMSV30基于双链加接头技术,对通过物理打断方法获得的DNA片段进行建库,并结合酶法转化,将非甲基化胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U)。结合DNBSEQ平台,该试剂盒能够以单碱基精度解析DNA甲基化状态,构建精细的全基因组甲基化图谱。
WGMSV30为众多生物医疗领域提供高效而精准的全基因组甲基化建库方案,包括大规模表观组研究、表观遗传基础科研、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选及药物研发等。当前,WGMSV30已成功适配MGISEQ-2000平台,并结合平台的升级算法,测序时可实现不添加平衡文库的0平衡文库纯甲基化文库测序。此外,华大智造研发团队正在进行适配DNBSEQ-T7的WGMSV30最后稳定性测试,更多实测数据将持续发布,敬请期待。
在采用3个不同批次的WGMSV30构建NA12878标准品的DNA甲基化文库时,不添加平衡文库平行上机MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂),进行PE150测序,单lane reads的产出基本稳定在400M左右。每个文库可获得约120G的原始下机数据,轻松实现“1库1lane”,且测序质量优秀,SM测序试剂Q30稳定在89%左右,SM20测序试剂Q30稳定在94%左右,Q40稳定在87%左右。Read1和Read2的测序碱基分布几乎稳定在一条水平线上,显示出高测序质量。
该试剂盒通过采用低损伤的酶法转化,增大了文库插入片段长度,更好地支持PE150测序。不同批次建库的NA12878标准品DNA甲基化文库的插入片段(主峰约280bp)表现一致。试剂盒优化了末端修复反应体系和步骤,降低了Reads末端M-bias碱基的个数。SM20版测序试剂搭配ECR71软件版本的结果显示,通过不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的M-bias表现一致,Bottom Strand和Top Strand的Read1与Read2甲基化率几乎重合。
俄罗斯专享会284致力于推动生物医疗领域的创新与发展,相信WGMSV30的推出将为研究人员提供更强大的工具,以推动甲基化研究的进展。